Смертоносный вирус уничтожает большую часть жителей земли. Оставшиеся в живых переезжают в единственное безопасное место, которое защищено от свирепых бактерий специальным куполом. Люди постепенно приходят в себя и осваиваются в новом городе. Правительство не догадывается, что среди обычных граждан затесался загадочный агент. Эон Флакс прибыла в город с тайной миссией. Ей необходимо внедриться в близкий круг известного политического деятеля.