Сидеть и скучать в планы Шегги и его компании не входит. Дружная команда отправляется в увлекательное путешествие. Оказавшись в каменистой пустыне, они сталкиваются с невероятным явлением. В небе над ними появляется светящийся объект, который начинает сопровождать авто друзей. Шегги не удается справиться с управлением, машина влетает в огромный кактус, который растет у обочины. Авария случилась в непосредственной близости к секретной станции,

Действие начинается с того, что Скуби-Ду, Скрепи, Даффи и их друзья Фред и Вельма приглашены в университет, где их друг Эрни работает над новой компьютерной игрой. Однако, когда они начинают играть, они обнаруживают, что внутри игры происходит нечто странное: персонажи становятся реальными и враждебными, а игровой мир начинает влиять на реальный мир. Команда Скуби-Ду понимает, что за всем этим стоит зловещий вирус, который пытается выйти из игры